La paléoprotéomique, un couteau suisse pour les archéologues et les paléontologues

Webinaire en français : La paléoprotéomique, un couteau suisse pour les archéologues et les paléontologues

La paléoprotéomique constitue aujourd’hui une avancée majeure pour l’identification taxonomique des vestiges anciens, notamment lorsque l’ADN est trop dégradé pour être exploitable. L’analyse des protéines, plus stables dans le temps, permet de différencier des espèces proches et d’affiner les classifications phylogénétiques. Par ailleurs, cette discipline offre la possibilité de déterminer le sexe des individus anciens, en s’appuyant notamment sur la détection de protéines sexuelles spécifiques, telles que les isoformes de l’amélogénine présentes dans les dents. Toutefois, l’exploitation du potentiel de la paléoprotéomique est encore limitée par l’existence du "dark protéome", correspondant aux régions protéiques mal caractérisées ou absentes des bases de données actuelles. Cette zone d’ombre représente un défi méthodologique important pour l’interprétation précise des résultats. Malgré ces limites, la paléoprotéomique enrichit considérablement les connaissances en paléontologie et en anthropologie biologique. Elle complète efficacement les données issues de l’ADN ancien et permet l’étude de périodes bien antérieures à celles accessibles par les approches génétiques classiques. En pleine expansion, cette discipline ouvre de nouvelles perspectives sur l’évolution et la diversité des espèces passées.

En assistant à cette présentation, vous en apprendrez davantage sur :

• L’impact de la paléoproteomique pour l'identification taxonomique
• Comment la protéomique peut aider à identifier le sexe d’individus anciens
• Le "dark protéome" en paléoproteomique
• Comment les plaques 96 puits AttractSPE® Disks C18 peuvent être utilisées pour dessaler de faibles quantités de peptides issues d’anciens ossements avant analyse par spectrométrie de masse

Animé par : Dr Florine Hallez, Cheffe de produit bioanalyse chez Affinisep

Intervenant invité :

Dr. Fabrice Bray, Ingénieur de recherche - CNRS, Laboratoire Miniaturisation pour la Synthèse, l’Analyse et la Protéomique (MSAP) - UAR 3290 - Université de Lille

Webinar in French (with slides in English): Paleoproteomics, a Swiss Army knife for archaeologists and paleontologists

Today, paleoproteomics represents a major advance in the taxonomic identification of ancient remains, particularly when the DNA is too degraded to be exploitable. Analysis of proteins, which are more stable over time, makes it possible to differentiate between closely related species and refine phylogenetic classifications. In addition, this discipline offers the possibility of determining the sex of ancient individuals, based in particular on the detection of sex-specific proteins, such as the isoforms of amelogenin present in teeth. However, exploiting the potential of paleoproteomics is still limited by the existence of the “dark proteome”, corresponding to protein regions that are poorly characterized or absent from current databases. This dark zone represents a major methodological challenge for the accurate interpretation of results. Despite these limitations, paleoproteomics considerably enriches our knowledge of paleontology and biological anthropology. It effectively complements ancient DNA data, enabling the study of periods well before those accessible through conventional genetic approaches. This rapidly expanding discipline opens up new perspectives on the evolution and diversity of past species.

By attending this presentation, you’ll learn more about:

• The impact of paleoproteomics on taxonomic identification
• How paleoproteomics can help determining the sex of ancient individuals
• The “dark proteome” in paleoproteomics
• How AttractSPE® Disks 96 well plates C18 can be used to desalt low peptide yields from ancient bones prior to MS analysis